这与茅台酒长时间的存储有关。我们看到的酒体微黄，其实是白酒中的联酮类化合物的颜色。随着白酒存储时间的增加，酒体内部发生的化学反应使得联酮类化合物含量增加，因而茅台酒存储时间越长，酒色越黄。但到了一定的酒精度数之后就会稳定下来，颜色始终保持在微黄的程度。
茅台酒遵循“三高三长”的酿造传统，高温制曲、高温堆积发酵、高温馏酒，高温也是促成酒体微黄的原因。高温制曲、高温堆积发酵使得茅台酒在发酵过程中产生了“美拉德反应”，氨基化合物和还原糖化合物之间发生反应，生成酮、醛、醇及呋喃、吡喃、吡啶等杂环化合物。
茅台酒遵循“三高三长”的酿造传统，高温制曲、高温堆积发酵、高温馏酒
美拉德反应在酸性环境下会生成有色产物，比如丁二酮，它是一种黄色油状液体的物质，从而让茅台酒看起来色泽晶莹微黄。茅台酒生产周期长达一年，历经两次投料、九次蒸煮、八次发酵、七次取酒，其中下沙至二次酒生产时，高温大曲的使用量较少，因而第一、二次的酒是没有颜色的。
到了第三次取酒，高温大曲的使用量增多，加上前两次发酵，美拉德反应产生的有色产物越来越多，使得第三次到第七次的酒体颜色逐渐变成微黄透明色。
美拉德反应在酸性环境下会生成有色产物
七次取酒之后，茅台酒还要经过三年时间的存贮，经过勾兑之后还要经过半年才能出厂，整体过程长达五年。在五年时间里，茅台酒体内部仍然在进行着美拉德反应，有色成分缓慢增加，酒体会逐渐变深。
一般来说，一瓶茅台酒的出厂几年到十几年后会渐变成淡黄色，
一般来说，一瓶茅台酒的出厂几年到十几年后会渐变成淡黄色，再长一些渐变成琥珀金色，但到几十年之后，酒体可能会透出轻微的绿的色泽，黄色反而没以前那么深了